O Hospital Infantil Dr. Jeser Amarante Faria tem em seu corpo diretivo os seguintes profissionais:
    
Ir. Ivete Negreli - Diretora geral
Estela Mari Galvan Cuchi - Diretora executiva
Douglas Alves Cláudio - Diretor administrativo
Dr. Rafael Oku Fernandes - Diretor técnico
Dr. Armando Vieira Lorga - Diretor clínico